Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Lrit1Q8K099 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Lrit1Q8K099 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Lrit1Q8K099 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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