Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnka2ipQ8CH19 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms