Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Slc43a2Q8CGA3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc43a2Q8CGA3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc43a2Q8CGA3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc43a2Q8CGA3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc43a2Q8CGA3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc43a2Q8CGA3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc43a2Q8CGA3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc43a2Q8CGA3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc43a2Q8CGA3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc43a2Q8CGA3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc43a2Q8CGA3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc43a2Q8CGA3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc43a2Q8CGA3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc43a2Q8CGA3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc43a2Q8CGA3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc43a2Q8CGA3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc43a2Q8CGA3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc43a2Q8CGA3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms