Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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