Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Usp27Q8CEG8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms