Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms