Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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