Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Vwc2Q8C8N3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Vwc2Q8C8N3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Vwc2Q8C8N3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Vwc2Q8C8N3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Vwc2Q8C8N3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vwc2Q8C8N3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vwc2Q8C8N3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vwc2Q8C8N3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vwc2Q8C8N3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vwc2Q8C8N3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vwc2Q8C8N3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms