Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ssxb2Q8C5Z3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ssxb2Q8C5Z3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ssxb2Q8C5Z3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ssxb2Q8C5Z3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ssxb2Q8C5Z3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ssxb2Q8C5Z3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ssxb2Q8C5Z3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ssxb2Q8C5Z3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb2Q8C5Z3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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