Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ttc21aQ8C0S4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ttc21aQ8C0S4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ttc21aQ8C0S4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ttc21aQ8C0S4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ttc21aQ8C0S4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ttc21aQ8C0S4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ttc21aQ8C0S4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ttc21aQ8C0S4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ttc21aQ8C0S4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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