Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rbbp5Q8BX09 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rbbp5Q8BX09 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rbbp5Q8BX09 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rbbp5Q8BX09 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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