Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Pggt1bQ8BUY9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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