Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms