Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms