Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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