Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Liat1Q810M6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms