Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms