Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cracr2bQ80ZJ8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cracr2bQ80ZJ8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cracr2bQ80ZJ8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cracr2bQ80ZJ8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cracr2bQ80ZJ8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cracr2bQ80ZJ8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cracr2bQ80ZJ8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cracr2bQ80ZJ8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms