Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Alkbh8Q80Y20 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Alkbh8Q80Y20 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms