Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ttc28Q80XJ3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ttc28Q80XJ3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ttc28Q80XJ3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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