Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
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