Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms