Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc93Q7TQK5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc93Q7TQK5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc93Q7TQK5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc93Q7TQK5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc93Q7TQK5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc93Q7TQK5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc93Q7TQK5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc93Q7TQK5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms