Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vma21Q78T54 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vma21Q78T54 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vma21Q78T54 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vma21Q78T54 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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