Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms