Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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