Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhb9Q6PB60 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms