Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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