Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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