Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Atg9aQ68FE2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Atg9aQ68FE2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Atg9aQ68FE2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Atg9aQ68FE2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms