Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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