Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

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Length 1,984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scn9aQ62205 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scn9aQ62205 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scn9aQ62205 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scn9aQ62205 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scn9aQ62205 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scn9aQ62205 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scn9aQ62205 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scn9aQ62205 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Scn9aQ62205 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn9aQ62205 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms