Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms