Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Slc6a4Q60857 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Slc6a4Q60857 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Slc6a4Q60857 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Slc6a4Q60857 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Slc6a4Q60857 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Slc6a4Q60857 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Slc6a4Q60857 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Slc6a4Q60857 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Slc6a4Q60857 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Slc6a4Q60857 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc6a4Q60857 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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