Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HellsQ60848 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms