Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms