Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms