Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms