Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin28bQ45KJ6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms