Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ttc9Q3V038 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ttc9Q3V038 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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