Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms