Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms