Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfdn4Q3UWL8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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