Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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