Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms