Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U595 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms