Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms