Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms