Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cpne9Q1RLL3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms