Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms